Sona C. Eypper studierte bei William A. Ward an der American University of Beirut Alte Geschichte mit Schwerpunkt auf dem antiken Mesopotamien. Ihre Masterarbeit schrieb sie zur Chronologie von Babylon im frühen zweiten Jahrtausend v. Chr. Ein DAAD-Stipendium ermöglichte ihr im Anschluss ein Studium der Altorientalistik an der Freien Universität Berlin. Unter Franz Köcher arbeitete sie hier zu babylonisch-assyrischen medizinischen Texten, wobei sie sich insbesondere auf Amulettstein-Texte konzentrierte.

Derzeit forscht Sona Eypper im Team von Markham J. Geller zu antiken mesopotamischen Abhandlungen über Erkrankungen der Füße. Ihre Untersuchung des Texts K.67+ zu Fußleiden erschien in Le Journal des Médecines Cunéiformes (2016).